Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC80Q76M96 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms