Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPOCD1Q6ZMY3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms