Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C16orf54Q6UWD8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms