Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H3F3CQ6NXT2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms