Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf140Q5VVS0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms