Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STRIP1Q5VSL9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms