Protein–RNA interactions for Protein: Q5RL73

RBM48, RNA-binding protein 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM48Q5RL73 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBM48Q5RL73 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBM48Q5RL73 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBM48Q5RL73 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBM48Q5RL73 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBM48Q5RL73 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBM48Q5RL73 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms