Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms