Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms