Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF8Q3BBV2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF8Q3BBV2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF8Q3BBV2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF8Q3BBV2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF8Q3BBV2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF8Q3BBV2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF8Q3BBV2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF8Q3BBV2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF8Q3BBV2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF8Q3BBV2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF8Q3BBV2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF8Q3BBV2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF8Q3BBV2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF8Q3BBV2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF8Q3BBV2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF8Q3BBV2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF8Q3BBV2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF8Q3BBV2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF8Q3BBV2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF8Q3BBV2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF8Q3BBV2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms