Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms