Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
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