Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPPQ16740 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms