Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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