Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITSN1Q15811 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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