Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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GBX1Q14549 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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GBX1Q14549 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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GBX1Q14549 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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GBX1Q14549 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GBX1Q14549 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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