Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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