Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms