Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTCH1Q13635 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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