Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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FOXE3Q13461 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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FOXE3Q13461 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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FOXE3Q13461 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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FOXE3Q13461 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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FOXE3Q13461 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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FOXE3Q13461 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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