Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATMQ13315 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATMQ13315 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATMQ13315 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATMQ13315 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATMQ13315 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATMQ13315 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATMQ13315 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATMQ13315 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATMQ13315 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATMQ13315 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATMQ13315 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATMQ13315 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATMQ13315 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATMQ13315 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATMQ13315 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATMQ13315 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATMQ13315 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATMQ13315 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATMQ13315 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATMQ13315 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATMQ13315 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATMQ13315 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATMQ13315 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATMQ13315 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATMQ13315 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATMQ13315 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATMQ13315 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATMQ13315 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATMQ13315 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATMQ13315 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATMQ13315 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATMQ13315 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATMQ13315 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATMQ13315 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATMQ13315 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATMQ13315 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATMQ13315 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATMQ13315 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATMQ13315 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATMQ13315 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATMQ13315 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATMQ13315 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATMQ13315 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATMQ13315 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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