Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NME3Q13232 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NME3Q13232 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NME3Q13232 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NME3Q13232 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME3Q13232 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME3Q13232 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME3Q13232 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME3Q13232 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NME3Q13232 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME3Q13232 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME3Q13232 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME3Q13232 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME3Q13232 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME3Q13232 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME3Q13232 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME3Q13232 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NME3Q13232 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME3Q13232 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME3Q13232 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME3Q13232 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME3Q13232 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME3Q13232 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME3Q13232 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME3Q13232 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME3Q13232 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME3Q13232 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME3Q13232 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME3Q13232 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME3Q13232 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME3Q13232 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME3Q13232 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME3Q13232 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME3Q13232 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME3Q13232 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME3Q13232 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME3Q13232 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME3Q13232 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME3Q13232 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME3Q13232 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NME3Q13232 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME3Q13232 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME3Q13232 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME3Q13232 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME3Q13232 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME3Q13232 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME3Q13232 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME3Q13232 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME3Q13232 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME3Q13232 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME3Q13232 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME3Q13232 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME3Q13232 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME3Q13232 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME3Q13232 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME3Q13232 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms