Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
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