Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms