Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms