Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms