Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEUP1Q05D60 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms