Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms