Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD3P84022 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms