Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMF1P82094 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMF1P82094 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMF1P82094 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMF1P82094 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMF1P82094 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMF1P82094 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMF1P82094 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMF1P82094 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMF1P82094 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMF1P82094 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMF1P82094 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMF1P82094 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMF1P82094 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMF1P82094 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMF1P82094 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMF1P82094 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMF1P82094 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMF1P82094 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMF1P82094 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMF1P82094 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMF1P82094 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMF1P82094 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMF1P82094 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMF1P82094 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMF1P82094 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMF1P82094 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMF1P82094 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMF1P82094 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMF1P82094 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMF1P82094 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMF1P82094 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMF1P82094 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMF1P82094 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMF1P82094 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMF1P82094 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMF1P82094 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMF1P82094 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMF1P82094 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMF1P82094 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMF1P82094 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMF1P82094 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMF1P82094 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms