Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GFRA1P56159 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms