Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms