Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFIP1P53367 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms