Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms