Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX1P48742 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX1P48742 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX1P48742 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX1P48742 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX1P48742 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX1P48742 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX1P48742 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX1P48742 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX1P48742 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX1P48742 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX1P48742 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX1P48742 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX1P48742 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX1P48742 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX1P48742 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX1P48742 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX1P48742 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX1P48742 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX1P48742 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX1P48742 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX1P48742 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX1P48742 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX1P48742 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX1P48742 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX1P48742 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX1P48742 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX1P48742 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX1P48742 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX1P48742 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX1P48742 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX1P48742 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX1P48742 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX1P48742 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX1P48742 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX1P48742 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX1P48742 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX1P48742 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX1P48742 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX1P48742 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX1P48742 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX1P48742 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX1P48742 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms