Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA4P43681 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA4P43681 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA4P43681 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA4P43681 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA4P43681 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA4P43681 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA4P43681 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA4P43681 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA4P43681 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA4P43681 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA4P43681 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms