Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRATP43155 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms