Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPOP42166 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPOP42166 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPOP42166 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPOP42166 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPOP42166 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPOP42166 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPOP42166 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms