Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms