Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC13P31276 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC13P31276 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms