Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GJB2P29033 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GJB2P29033 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJB2P29033 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJB2P29033 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJB2P29033 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJB2P29033 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJB2P29033 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJB2P29033 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJB2P29033 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GJB2P29033 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GJB2P29033 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GJB2P29033 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GJB2P29033 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms