Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

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Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHATP28329 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHATP28329 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHATP28329 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHATP28329 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHATP28329 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHATP28329 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHATP28329 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHATP28329 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CHATP28329 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHATP28329 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHATP28329 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHATP28329 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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