Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMA3P25788 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms