Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF1P22415 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF1P22415 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF1P22415 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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