Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRP12270 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRP12270 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRP12270 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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