Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBSLP0DN79 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBSLP0DN79 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms