Protein–RNA interactions for Protein: O75365

PTP4A3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A3O75365 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A3O75365 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms