Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CALUO43852 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CALUO43852 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALUO43852 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CALUO43852 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALUO43852 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALUO43852 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALUO43852 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALUO43852 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALUO43852 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALUO43852 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALUO43852 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALUO43852 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALUO43852 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALUO43852 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALUO43852 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALUO43852 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALUO43852 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALUO43852 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALUO43852 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALUO43852 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALUO43852 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALUO43852 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALUO43852 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALUO43852 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALUO43852 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALUO43852 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALUO43852 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALUO43852 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALUO43852 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CALUO43852 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALUO43852 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALUO43852 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CALUO43852 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms