Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBDO15205 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBDO15205 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBDO15205 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBDO15205 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBDO15205 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBDO15205 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBDO15205 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBDO15205 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBDO15205 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBDO15205 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBDO15205 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBDO15205 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBDO15205 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms