Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms